请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版
查看: 1641|回复: 2

[高产技术] 上海生科院利用CRISPR/Cas9系统对水稻基因组进行高效碱基替换

[复制链接]

73

主题

73

帖子

234

积分

实习版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
234
发表于 2016-12-15 16:00:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
     12月5日,《分子植物》(Molecular Plant)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Precise editing of a target base in the rice genome using a modified CRISPR/Cas9 system 的研究论文。该研究利用碱基修饰酶APOBEC1在水稻中开发了CRISPR/Cas9的碱基编辑技术,提供了一种简单高效的碱基突变方法,将进一步促进CRISPR/Cas9技术在植物基因组学研究和农作物分子设计育种中的应用。

  碱基置换突变指一个碱基被另一个碱基取代,是最常见的突变形式。越来越多的研究表明,大部分生物性状的改变都存在着相关基因的突变,其中以碱基置换突变即点突变最为常见。寻求高效的单碱基编辑技术一直以来都是植物研究的热点和难点。目前,CRISPR/Cas9系统都利用修复途径中占非主导作用的同源介导修复(HDR)来实现更为精确的基因编辑,但该修复的效率很低,大大影响了CRISPR/Cas9的编辑效果。近日,哈佛大学的研究人员通过将能将胞嘧啶(C)转变为尿嘧啶(U)的碱基修饰酶APOBEC1与改造后的切单链DNA的Cas9绑定在一起,构建了一种新型的碱基编辑器。在该系统中,不需要切断双链DNA,导向RNA将改造的Cas9引导到目标位置,碱基修饰酶APOBEC1发挥碱基置换作用。该系统已在人类细胞中证实,可实现高效的靶向碱基C→T或者G→A的碱基编辑。

  逆境中心朱健康研究组基于APOBEC1功能,在水稻中开发了一种新的碱基编辑系统。研究人员合成了APOBEC1,并利用XTEN作为接头,将其融合到Cas9(D10A)的N末端,同时将核定位信号肽(NLS)添加到Cas9(D10A)的C末端。改造后半激活式的Cas9可切割非编辑的那条链,并通过诱导碱基切除修复(base-excision repair)解决U:G的错配,从而实现高效的碱基替换。研究人员通过对两个编码重要农艺性状的水稻基因NRT1.1B和SLR1进行单碱基C→T或C→G的单碱基编辑,单碱基替换的效率为1.4%-11.5%,与在动物中的编辑效率相似(1.6%-3.9%)。但同时也发现,在水稻稳定遗传转化系统中,有大约10%的序列显示核苷酸的插入。

  该研究利用碱基修饰酶实现了C→T和C→G(G→A和G→C)替换,在植物中建立的碱基编辑策略具有简单、高效以及部分适用性的优点,将使得特定碱基编辑成为植物基因功能研究和作物育种的一种常规实践。该技术大大拓展了CRISPR/Cas9技术在植物中的应用,为植物基因功能解析和作物分子育种提供了一项新的技术路线。

  该工作得到了中科院经费的支持。

WjWI-fxytqav9291179.jpg
上海生科院利用CRISPR/Cas9系统对水稻基因组进行高效碱基替换

  12月5日,《分子植物》(Molecular Plant)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Precise editing of a target base in the rice genome using a modified CRISPR/Cas9 system 的研究论文。该研究利用碱基修饰酶APOBEC1在水稻中开发了CRISPR/Cas9的碱基编辑技术,提供了一种简单高效的碱基突变方法,将进一步促进CRISPR/Cas9技术在植物基因组学研究和农作物分子设计育种中的应用。

  碱基置换突变指一个碱基被另一个碱基取代,是最常见的突变形式。越来越多的研究表明,大部分生物性状的改变都存在着相关基因的突变,其中以碱基置换突变即点突变最为常见。寻求高效的单碱基编辑技术一直以来都是植物研究的热点和难点。目前,CRISPR/Cas9系统都利用修复途径中占非主导作用的同源介导修复(HDR)来实现更为精确的基因编辑,但该修复的效率很低,大大影响了CRISPR/Cas9的编辑效果。近日,哈佛大学的研究人员通过将能将胞嘧啶(C)转变为尿嘧啶(U)的碱基修饰酶APOBEC1与改造后的切单链DNA的Cas9绑定在一起,构建了一种新型的碱基编辑器。在该系统中,不需要切断双链DNA,导向RNA将改造的Cas9引导到目标位置,碱基修饰酶APOBEC1发挥碱基置换作用。该系统已在人类细胞中证实,可实现高效的靶向碱基C→T或者G→A的碱基编辑。

  逆境中心朱健康研究组基于APOBEC1功能,在水稻中开发了一种新的碱基编辑系统。研究人员合成了APOBEC1,并利用XTEN作为接头,将其融合到Cas9(D10A)的N末端,同时将核定位信号肽(NLS)添加到Cas9(D10A)的C末端。改造后半激活式的Cas9可切割非编辑的那条链,并通过诱导碱基切除修复(base-excision repair)解决U:G的错配,从而实现高效的碱基替换。研究人员通过对两个编码重要农艺性状的水稻基因NRT1.1B和SLR1进行单碱基C→T或C→G的单碱基编辑,单碱基替换的效率为1.4%-11.5%,与在动物中的编辑效率相似(1.6%-3.9%)。但同时也发现,在水稻稳定遗传转化系统中,有大约10%的序列显示核苷酸的插入。

  该研究利用碱基修饰酶实现了C→T和C→G(G→A和G→C)替换,在植物中建立的碱基编辑策略具有简单、高效以及部分适用性的优点,将使得特定碱基编辑成为植物基因功能研究和作物育种的一种常规实践。该技术大大拓展了CRISPR/Cas9技术在植物中的应用,为植物基因功能解析和作物分子育种提供了一项新的技术路线。

  该工作得到了中科院经费的支持。
WjWI-fxytqav9291179.jpg
上海生科院利用CRISPR/Cas9系统对水稻基因组进行高效碱基替换
回复

使用道具 举报

0

主题

95

帖子

197

积分

注册会员

Rank: 2

积分
197
发表于 2018-1-22 15:30:51 | 显示全部楼层
michael kors factory outlet
longchamp
adidas shoes
yeezy shoes
van cleef
yeezy boost
nike roshe run
converse outlet store
red bottom shoes
falcons jersey
yeezy shoes
adidas gazelle
bape hoodie
lebron 14 shoes
tom ford sunglasses
goyard handbags
nhl jerseys
cat boots
jordan 12
moncler jackets
cheap basketball shoes
nike zoom
michael jordan shoes
yeezy shoes
adidas ultra boost
adidas stan smith shoes
af1
adidas yeezy
tory burch shoes
nike mercurial
longchamp handbags
louboutin shoes uk
lebron shoes
air jordan shoes
air max 2017
yeezy shoes
hermes handbags
adidas ultra boost uncaged
curry 4
adidas yeezy
ferragamo belts
kobe 9
lebron 15
adidas tubular
kate spade outlet
adidas nmd r1
stephen curry shoes
nike hyperdunk 2017
adidas tubular
fitflops sale clearance
kate spade outlet online
converse shoes
adidas superstar
michael kors outlet store
dior sunglasses
nike air force 1
golden goose
timberland outlet
longchamp handbags
adidas superstar shoes
led shoes
michael kors outlet
lebron 13 shoes
cheap jordans
nike air force 1
nike lebron soldier 11
hogan outlet online
yeezy shoes
jordan 11 retro
air max 90
derrick rose shoes
kyrie 3
golden goose
lacoste online shop
mlb jerseys
jordan 13
off white clothing
curry 3 shoes
moncler outlet
adidas online shop
yeezy boost 350
tory burch shoes
http://www.kobeshoes.uk
michael kors uk
nike free run
nike air max 90
adidas store
vibram five fingers
adidas nmd
yeezys
brady jersey
chrome hearts online
jordan shoes
adidas outlet online
longchamp bags
lebron soldier 10
adidas tubular shadow
golden goose sneakers
asics gel kayano
adidas tubular
nike huarache
gucci belts
birkin bag
air jordan 13
harden shoes
birkin bag
nike air force
adidas nmd
jordan shoes
hermes belt
gucci belt
cheap mlb jerseys
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

77

帖子

161

积分

注册会员

Rank: 2

积分
161
发表于 2018-1-26 11:43:07 | 显示全部楼层
longchamp pliage
ugg outlet
nike store uk
ralph lauren polo shirts
oakley sunglasses
canada goose jackets
oakley sunglasses
polo outlet
oakley sunglasses
kobe 9
coach factory outlet
michael kors outlet
swarovski outlet
ray ban sunglasses
ralph lauren outlet
chicago blackhawks jerseys
michael kors uk
ray ban sunglasses
air max trainers
fred perry polo shirts
reebok outlet store
ugg outlet
cheap mlb jerseys
nike air max 90
polo ralph lauren
mulberry bags
supreme clothing
oakley sunglasses
michael kors handbags
ray ban sunglasses
canada goose parka
pandora charms sale clearance
polo outlet
giuseppe zanotti outlet
air max 90
ray ban sunglasses
ecco shoes
christian louboutin shoes
christian louboutin outlet
ed hardy clothing
coach outlet
kevin durant shoes
pandora outlet
polo outlet
ugg boots
rayban sunglasses
ray ban sunglasses
canada goose outlet
uggs outlet
coach outlet
michael kors outlet
ugg boots clearance
nike shoes
links of london
coach outlet
nike shoes
ugg outlet
polo ralph lauren
coach outlet
nike store
jordan shoes
football shirts
michael kors wallets
michael kors outlet
lebron james shoes
michael kors outlet
coach outlet online
marc jacobs outlet
canada goose outlet
michael kors outlet
true religion outlet
michael kors handbags
burberry outlet
fitflops sale clearance
ugg boots
ralph lauren polo
jordan shoes
pandora outlet
pandora jewelry
polo outlet
oakley sunglasses wholesale
true religion jeans
chrome hearts outlet
futbol baratas
mont blanc pens
nike shoes
canada goose jackets
coach outlet online
ugg outlet
canada goose jackets
ferragamo outlet
michael kors outlet
christian louboutin shoes
ray-ban sunglasses
longchamp outlet
christian louboutin online
canada goose outlet
polo ralph lauren
cheap nfl jerseys
canada goose outlet
pandora outlet
christian louboutin outlet
true religion jeans
salomon shoes
converse shoes
true religion jeans
mulberry sale
oakley sunglasses
20180126caihuali
回复 支持 反对

使用道具 举报

使用 高级模式(可批量传图、插入视频等)
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册